Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms