Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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