Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 AL512356.3-201ENST00000623005 461 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms