Protein–RNA interactions for Protein: Q96TA2

YME1L1, ATP-dependent zinc metalloprotease YME1L1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YME1L1Q96TA2 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
YME1L1Q96TA2 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms