Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms