Protein–RNA interactions for Protein: Q96HA7

TONSL, Tonsoku-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TONSLQ96HA7 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TONSLQ96HA7 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TONSLQ96HA7 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms