Protein–RNA interactions for Protein: Q96FS4

SIPA1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1Q96FS4 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIPA1Q96FS4 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms