Protein–RNA interactions for Protein: Q96FM1

PGAP3, Post-GPI attachment to proteins factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAP3Q96FM1 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms