Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms