Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms