Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NCSTNQ92542 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms