Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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RNF148Q8N7C7 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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RNF148Q8N7C7 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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RNF148Q8N7C7 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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RNF148Q8N7C7 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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RNF148Q8N7C7 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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