Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 CIDEC-205ENST00000443115 443 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 AP003785.1-201ENST00000544959 492 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 MAD2L1BP-201ENST00000372171 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 AC091588.3-201ENST00000583442 770 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 AC006207.1-201ENST00000637958 562 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 AL050341.2-201ENST00000567508 1541 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
STRCQ7RTU9 BLVRA-201ENST00000265523 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms