Protein–RNA interactions for Protein: Q6YBV0

SLC36A4, Proton-coupled amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A4Q6YBV0 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC36A4Q6YBV0 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC36A4Q6YBV0 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC36A4Q6YBV0 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC36A4Q6YBV0 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms