Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
STRIP1Q5VSL9 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms