Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms