Protein–RNA interactions for Protein: Q5FBB7

SGO1, Shugoshin 1, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO1Q5FBB7 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGO1Q5FBB7 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms