Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms