Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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