Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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