Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms