Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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