Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
FXNQ16595 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
FXNQ16595 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
FXNQ16595 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
FXNQ16595 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
FXNQ16595 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
FXNQ16595 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
FXNQ16595 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
FXNQ16595 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
FXNQ16595 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
FXNQ16595 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
FXNQ16595 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
FXNQ16595 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
FXNQ16595 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
FXNQ16595 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
FXNQ16595 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
FXNQ16595 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
FXNQ16595 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
FXNQ16595 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
FXNQ16595 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
FXNQ16595 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
FXNQ16595 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
FXNQ16595 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
FXNQ16595 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
FXNQ16595 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
FXNQ16595 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
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FXNQ16595 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
FXNQ16595 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
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FXNQ16595 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
FXNQ16595 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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FXNQ16595 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
FXNQ16595 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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FXNQ16595 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
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FXNQ16595 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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FXNQ16595 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
FXNQ16595 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
FXNQ16595 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
FXNQ16595 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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FXNQ16595 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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FXNQ16595 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
FXNQ16595 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
FXNQ16595 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
FXNQ16595 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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FXNQ16595 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
FXNQ16595 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
FXNQ16595 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
FXNQ16595 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
FXNQ16595 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
FXNQ16595 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC14.41□□□□□ -0.1
FXNQ16595 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
FXNQ16595 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
FXNQ16595 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
FXNQ16595 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
FXNQ16595 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
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