Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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RPE65Q16518 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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RPE65Q16518 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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RPE65Q16518 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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RPE65Q16518 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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RPE65Q16518 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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