Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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CNGA3Q16281 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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CNGA3Q16281 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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CNGA3Q16281 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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CNGA3Q16281 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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CNGA3Q16281 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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CNGA3Q16281 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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CNGA3Q16281 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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CNGA3Q16281 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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CNGA3Q16281 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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CNGA3Q16281 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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CNGA3Q16281 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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CNGA3Q16281 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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CNGA3Q16281 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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CNGA3Q16281 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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