Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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