Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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CDSNQ15517 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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CDSNQ15517 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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CDSNQ15517 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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CDSNQ15517 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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