Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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