Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EEA1Q15075 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EEA1Q15075 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
EEA1Q15075 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
EEA1Q15075 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
EEA1Q15075 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
EEA1Q15075 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
EEA1Q15075 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EEA1Q15075 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EEA1Q15075 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EEA1Q15075 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EEA1Q15075 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EEA1Q15075 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EEA1Q15075 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EEA1Q15075 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EEA1Q15075 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EEA1Q15075 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
EEA1Q15075 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EEA1Q15075 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EEA1Q15075 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EEA1Q15075 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EEA1Q15075 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EEA1Q15075 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EEA1Q15075 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EEA1Q15075 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EEA1Q15075 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
EEA1Q15075 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EEA1Q15075 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EEA1Q15075 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EEA1Q15075 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EEA1Q15075 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EEA1Q15075 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EEA1Q15075 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EEA1Q15075 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EEA1Q15075 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EEA1Q15075 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EEA1Q15075 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EEA1Q15075 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EEA1Q15075 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EEA1Q15075 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EEA1Q15075 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EEA1Q15075 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EEA1Q15075 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EEA1Q15075 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EEA1Q15075 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EEA1Q15075 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EEA1Q15075 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EEA1Q15075 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EEA1Q15075 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
EEA1Q15075 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EEA1Q15075 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
EEA1Q15075 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
EEA1Q15075 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EEA1Q15075 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
EEA1Q15075 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EEA1Q15075 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EEA1Q15075 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EEA1Q15075 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EEA1Q15075 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
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