Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GBX1Q14549 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GBX1Q14549 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GBX1Q14549 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GBX1Q14549 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GBX1Q14549 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GBX1Q14549 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GBX1Q14549 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GBX1Q14549 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GBX1Q14549 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GBX1Q14549 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GBX1Q14549 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GBX1Q14549 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GBX1Q14549 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GBX1Q14549 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GBX1Q14549 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GBX1Q14549 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GBX1Q14549 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GBX1Q14549 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GBX1Q14549 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GBX1Q14549 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GBX1Q14549 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GBX1Q14549 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GBX1Q14549 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GBX1Q14549 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GBX1Q14549 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GBX1Q14549 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GBX1Q14549 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GBX1Q14549 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GBX1Q14549 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GBX1Q14549 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GBX1Q14549 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GBX1Q14549 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GBX1Q14549 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GBX1Q14549 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GBX1Q14549 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms