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| HES1 | Q14469 | RPS5-201 | ENST00000196551 | 740 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.56 | □□□□□ -0.4 | | |
| HES1 | Q14469 | GYPC-201 | ENST00000259254 | 1246 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 12.56 | □□□□□ -0.4 | | |
| HES1 | Q14469 | FTH1-201 | ENST00000273550 | 1229 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.56 | □□□□□ -0.4 | | |
| HES1 | Q14469 | UBB-201 | ENST00000302182 | 1225 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.56 | □□□□□ -0.4 | | |
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| HES1 | Q14469 | AL133267.1-201 | ENST00000398220 | 340 nt | BASIC | 12.56 | □□□□□ -0.4 | | |
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| HES1 | Q14469 | EIF2AK4-208 | ENST00000559624 | 3548 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.55 | □□□□□ -0.4 | | |
| HES1 | Q14469 | IKZF1-202 | ENST00000343574 | 5925 nt | TSL 5 BASIC | 12.55 | □□□□□ -0.4 | | |
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| HES1 | Q14469 | CENPO-202 | ENST00000380834 | 4386 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 12.55 | □□□□□ -0.4 | | |
| HES1 | Q14469 | PCDHGA11-201 | ENST00000398587 | 4647 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 12.55 | □□□□□ -0.4 | | |
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| HES1 | Q14469 | GDF5-201 | ENST00000374369 | 2383 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.55 | □□□□□ -0.4 | | |
| HES1 | Q14469 | ALOX15B-204 | ENST00000572022 | 2396 nt | TSL 2 BASIC | 12.55 | □□□□□ -0.4 | | |
| HES1 | Q14469 | CHRFAM7A-201 | ENST00000299847 | 6220 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.55 | □□□□□ -0.4 | | |
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| HES1 | Q14469 | PIR-201 | ENST00000380420 | 1282 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.55 | □□□□□ -0.4 | | |
| HES1 | Q14469 | IDH3B-202 | ENST00000380851 | 1230 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 12.55 | □□□□□ -0.4 | | |
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| HES1 | Q14469 | TCP10-201 | ENST00000366827 | 2250 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 12.55 | □□□□□ -0.4 | | |
| HES1 | Q14469 | MYLK-201 | ENST00000346322 | 5892 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 12.55 | □□□□□ -0.4 | | |
| HES1 | Q14469 | SLC25A29-208 | ENST00000554912 | 5169 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.55 | □□□□□ -0.4 | | |
| HES1 | Q14469 | TMED1-201 | ENST00000214869 | 1340 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.55 | □□□□□ -0.4 | | |