Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTAN1Q13813 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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