Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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ITGA9Q13797 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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ITGA9Q13797 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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ITGA9Q13797 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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ITGA9Q13797 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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ITGA9Q13797 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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ITGA9Q13797 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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ITGA9Q13797 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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ITGA9Q13797 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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ITGA9Q13797 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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ITGA9Q13797 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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ITGA9Q13797 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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