Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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