Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms