Protein–RNA interactions for Protein: Q13573

SNW1, SNW domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNW1Q13573 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNW1Q13573 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNW1Q13573 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNW1Q13573 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNW1Q13573 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNW1Q13573 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNW1Q13573 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNW1Q13573 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNW1Q13573 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNW1Q13573 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNW1Q13573 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SNW1Q13573 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNW1Q13573 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNW1Q13573 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SNW1Q13573 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNW1Q13573 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNW1Q13573 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNW1Q13573 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNW1Q13573 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNW1Q13573 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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