Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM28Q13263 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM28Q13263 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM28Q13263 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM28Q13263 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM28Q13263 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM28Q13263 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM28Q13263 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM28Q13263 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM28Q13263 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM28Q13263 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM28Q13263 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM28Q13263 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM28Q13263 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM28Q13263 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM28Q13263 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM28Q13263 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM28Q13263 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM28Q13263 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM28Q13263 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM28Q13263 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM28Q13263 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM28Q13263 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM28Q13263 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM28Q13263 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM28Q13263 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM28Q13263 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM28Q13263 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM28Q13263 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM28Q13263 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM28Q13263 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM28Q13263 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM28Q13263 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM28Q13263 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM28Q13263 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM28Q13263 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM28Q13263 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM28Q13263 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM28Q13263 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM28Q13263 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM28Q13263 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM28Q13263 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM28Q13263 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM28Q13263 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM28Q13263 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM28Q13263 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM28Q13263 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM28Q13263 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM28Q13263 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM28Q13263 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM28Q13263 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM28Q13263 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM28Q13263 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM28Q13263 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM28Q13263 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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