Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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