Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 CADM1-221ENST00000612235 1042 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms