Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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