Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms