Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGM3Q08188 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TGM3Q08188 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGM3Q08188 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGM3Q08188 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGM3Q08188 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGM3Q08188 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGM3Q08188 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGM3Q08188 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGM3Q08188 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGM3Q08188 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGM3Q08188 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGM3Q08188 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGM3Q08188 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGM3Q08188 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGM3Q08188 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGM3Q08188 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGM3Q08188 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGM3Q08188 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGM3Q08188 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TGM3Q08188 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGM3Q08188 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGM3Q08188 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGM3Q08188 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TGM3Q08188 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGM3Q08188 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGM3Q08188 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TGM3Q08188 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGM3Q08188 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGM3Q08188 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGM3Q08188 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGM3Q08188 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGM3Q08188 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGM3Q08188 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGM3Q08188 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGM3Q08188 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGM3Q08188 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGM3Q08188 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGM3Q08188 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGM3Q08188 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGM3Q08188 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TGM3Q08188 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGM3Q08188 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGM3Q08188 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGM3Q08188 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGM3Q08188 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TGM3Q08188 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TGM3Q08188 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TGM3Q08188 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGM3Q08188 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGM3Q08188 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGM3Q08188 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGM3Q08188 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGM3Q08188 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGM3Q08188 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGM3Q08188 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGM3Q08188 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGM3Q08188 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGM3Q08188 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGM3Q08188 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.7 ms