Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FMODQ06828 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FMODQ06828 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FMODQ06828 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FMODQ06828 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FMODQ06828 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FMODQ06828 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FMODQ06828 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FMODQ06828 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FMODQ06828 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FMODQ06828 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FMODQ06828 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FMODQ06828 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FMODQ06828 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FMODQ06828 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FMODQ06828 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FMODQ06828 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FMODQ06828 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FMODQ06828 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FMODQ06828 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FMODQ06828 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FMODQ06828 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FMODQ06828 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FMODQ06828 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FMODQ06828 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FMODQ06828 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FMODQ06828 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FMODQ06828 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FMODQ06828 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FMODQ06828 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FMODQ06828 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FMODQ06828 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FMODQ06828 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FMODQ06828 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FMODQ06828 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FMODQ06828 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FMODQ06828 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FMODQ06828 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FMODQ06828 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FMODQ06828 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FMODQ06828 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FMODQ06828 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FMODQ06828 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FMODQ06828 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FMODQ06828 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FMODQ06828 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FMODQ06828 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FMODQ06828 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FMODQ06828 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FMODQ06828 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FMODQ06828 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FMODQ06828 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FMODQ06828 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FMODQ06828 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FMODQ06828 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FMODQ06828 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FMODQ06828 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FMODQ06828 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FMODQ06828 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FMODQ06828 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FMODQ06828 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FMODQ06828 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FMODQ06828 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FMODQ06828 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FMODQ06828 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FMODQ06828 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FMODQ06828 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
FMODQ06828 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FMODQ06828 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FMODQ06828 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FMODQ06828 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FMODQ06828 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FMODQ06828 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FMODQ06828 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FMODQ06828 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FMODQ06828 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FMODQ06828 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FMODQ06828 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FMODQ06828 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FMODQ06828 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FMODQ06828 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FMODQ06828 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FMODQ06828 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FMODQ06828 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FMODQ06828 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FMODQ06828 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FMODQ06828 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FMODQ06828 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FMODQ06828 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FMODQ06828 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FMODQ06828 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FMODQ06828 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FMODQ06828 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FMODQ06828 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FMODQ06828 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FMODQ06828 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FMODQ06828 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
FMODQ06828 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FMODQ06828 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FMODQ06828 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms