Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 OR2A42-201ENST00000391496 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 OR2A1-201ENST00000408951 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AL355802.1-201ENST00000417591 990 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AC239804.1-201ENST00000466343 869 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 LINC02434-201ENST00000502419 677 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AC005229.3-201ENST00000603438 323 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AC005066.1-201ENST00000613582 1007 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 Metazoa_SRP.62-201ENST00000619972 268 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AL049536.1-202ENST00000623572 455 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AC006511.4-201ENST00000631571 561 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms