Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms