Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 CTB-178M22.2-201ENST00000519795 503 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms