Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK3Q00526 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK3Q00526 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK3Q00526 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK3Q00526 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK3Q00526 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK3Q00526 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK3Q00526 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK3Q00526 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK3Q00526 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK3Q00526 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK3Q00526 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK3Q00526 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK3Q00526 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK3Q00526 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK3Q00526 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK3Q00526 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK3Q00526 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK3Q00526 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK3Q00526 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK3Q00526 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK3Q00526 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK3Q00526 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK3Q00526 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK3Q00526 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK3Q00526 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CDK3Q00526 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK3Q00526 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK3Q00526 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK3Q00526 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK3Q00526 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK3Q00526 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK3Q00526 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK3Q00526 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK3Q00526 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK3Q00526 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK3Q00526 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK3Q00526 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK3Q00526 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CDK3Q00526 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CDK3Q00526 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CDK3Q00526 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK3Q00526 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK3Q00526 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK3Q00526 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK3Q00526 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK3Q00526 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK3Q00526 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK3Q00526 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK3Q00526 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK3Q00526 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDK3Q00526 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK3Q00526 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK3Q00526 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK3Q00526 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK3Q00526 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK3Q00526 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK3Q00526 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK3Q00526 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK3Q00526 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK3Q00526 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK3Q00526 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK3Q00526 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK3Q00526 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK3Q00526 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDK3Q00526 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK3Q00526 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK3Q00526 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK3Q00526 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK3Q00526 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK3Q00526 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK3Q00526 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK3Q00526 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK3Q00526 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK3Q00526 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK3Q00526 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK3Q00526 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDK3Q00526 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK3Q00526 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK3Q00526 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDK3Q00526 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK3Q00526 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK3Q00526 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK3Q00526 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK3Q00526 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK3Q00526 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK3Q00526 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK3Q00526 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK3Q00526 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CDK3Q00526 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDK3Q00526 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDK3Q00526 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDK3Q00526 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDK3Q00526 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDK3Q00526 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDK3Q00526 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDK3Q00526 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDK3Q00526 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDK3Q00526 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CDK3Q00526 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms