Protein–RNA interactions for Protein: P84085

ARF5, ADP-ribosylation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF5P84085 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF5P84085 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF5P84085 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF5P84085 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF5P84085 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF5P84085 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF5P84085 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF5P84085 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF5P84085 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF5P84085 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF5P84085 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF5P84085 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF5P84085 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF5P84085 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF5P84085 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF5P84085 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF5P84085 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF5P84085 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF5P84085 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF5P84085 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF5P84085 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF5P84085 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF5P84085 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF5P84085 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF5P84085 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF5P84085 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF5P84085 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF5P84085 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF5P84085 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF5P84085 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF5P84085 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF5P84085 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF5P84085 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF5P84085 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF5P84085 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF5P84085 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF5P84085 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF5P84085 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF5P84085 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF5P84085 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF5P84085 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF5P84085 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF5P84085 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF5P84085 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF5P84085 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF5P84085 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF5P84085 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF5P84085 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF5P84085 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF5P84085 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF5P84085 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF5P84085 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF5P84085 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF5P84085 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF5P84085 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF5P84085 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF5P84085 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF5P84085 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF5P84085 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF5P84085 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF5P84085 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF5P84085 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF5P84085 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF5P84085 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF5P84085 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF5P84085 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF5P84085 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF5P84085 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF5P84085 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF5P84085 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF5P84085 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF5P84085 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF5P84085 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF5P84085 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF5P84085 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF5P84085 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF5P84085 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF5P84085 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF5P84085 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF5P84085 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF5P84085 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF5P84085 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF5P84085 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF5P84085 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF5P84085 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF5P84085 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF5P84085 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF5P84085 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF5P84085 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF5P84085 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF5P84085 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF5P84085 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF5P84085 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF5P84085 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF5P84085 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF5P84085 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF5P84085 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF5P84085 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF5P84085 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF5P84085 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms