Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.67□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms