Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms